Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chrac1Q9JKP8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms