Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pard6bQ9JK83 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pard6bQ9JK83 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms