Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cnga3Q9JJZ8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnga3Q9JJZ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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