Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Praf2Q9JIG8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Praf2Q9JIG8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms