Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pus3Q9JI38 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pus3Q9JI38 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pus3Q9JI38 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pus3Q9JI38 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pus3Q9JI38 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pus3Q9JI38 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms