Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc4Q9ES56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc4Q9ES56 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms