Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SelenofQ9ERR7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenofQ9ERR7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms