Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lima1Q9ERG0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lima1Q9ERG0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms