Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SyncQ9EPM5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SyncQ9EPM5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms