Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ap3s1Q9DCR2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ap3s1Q9DCR2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms