Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smg9Q9DB90 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Smg9Q9DB90 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Smg9Q9DB90 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Smg9Q9DB90 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smg9Q9DB90 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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