Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx5Q9D8U8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx5Q9D8U8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms