Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tvp23bQ9D8T4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tvp23bQ9D8T4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms