Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lin37Q9D8N6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lin37Q9D8N6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms