Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q9D8L0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q9D8L0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q9D8L0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms