Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slx4ipQ9D7Y9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slx4ipQ9D7Y9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms