Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn22Q9D7U6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn22Q9D7U6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms