Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhox2aQ9D4Y3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhox2aQ9D4Y3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms