Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2al3Q9D4U4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2al3Q9D4U4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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