Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tchhl1Q9D3P1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tchhl1Q9D3P1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tchhl1Q9D3P1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tchhl1Q9D3P1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tchhl1Q9D3P1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tchhl1Q9D3P1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tchhl1Q9D3P1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tchhl1Q9D3P1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tchhl1Q9D3P1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms