Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Obox1Q9D350 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Obox1Q9D350 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Obox1Q9D350 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms