Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx20Q9D2Y5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx20Q9D2Y5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms