Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ankrd39Q9D2X0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ankrd39Q9D2X0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms