Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q9D2Q3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q9D2Q3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q9D2Q3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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