Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gtf2e1Q9D0D5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Gtf2e1Q9D0D5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms