Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnajc18Q9CZJ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnajc18Q9CZJ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms