Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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