Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx7Q9CY18 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx7Q9CY18 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms