Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Utp23Q9CX11 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms