Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc5Q9CRA8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms