Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rer1Q9CQU3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rer1Q9CQU3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rer1Q9CQU3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms