Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ79

Txndc9, Thioredoxin domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc9Q9CQ79 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Txndc9Q9CQ79 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Txndc9Q9CQ79 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms