Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Med21Q9CQ39 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms