Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp3Q9CQ10 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp3Q9CQ10 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp3Q9CQ10 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms