Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdac9Q99N13 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdac9Q99N13 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms