Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gdpd3Q99LY2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gdpd3Q99LY2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms