Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hps4Q99KG7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hps4Q99KG7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hps4Q99KG7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms