Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csmd1Q923L3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csmd1Q923L3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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