Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Med28Q920D3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Med28Q920D3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms