Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atl3Q91YH5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atl3Q91YH5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atl3Q91YH5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms