Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEH2

Ciz1, CDKN1A-interacting zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciz1Q8VEH2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ciz1Q8VEH2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ciz1Q8VEH2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciz1Q8VEH2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciz1Q8VEH2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciz1Q8VEH2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciz1Q8VEH2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciz1Q8VEH2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciz1Q8VEH2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciz1Q8VEH2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciz1Q8VEH2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ciz1Q8VEH2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms