Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ubxn4Q8VCH8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ubxn4Q8VCH8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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