Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RfxapQ8VCG9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RfxapQ8VCG9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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