Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ApobrQ8VBT6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ApobrQ8VBT6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms