Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trim29Q8R2Q0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.2 ms