Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E6

V1ra11, Vomeronasal type-1 receptor A11, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra11Q8R2E6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms