Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccm2Q8K2Y9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccm2Q8K2Y9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms