Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkn3Q8K045 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkn3Q8K045 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkn3Q8K045 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkn3Q8K045 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkn3Q8K045 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkn3Q8K045 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms