Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms