Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clip4Q8CI96 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clip4Q8CI96 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms